1、用途不同：
香芹：一般比较干，而且比较香，多做香料使用；可生食或用肉类煮食，也可作为菜肴的干香调料或做羹汤及其他蔬菜食品的调味品。
水芹：一般比较多水分，只是作为蔬菜的一种来使用。
2、外形不同：
香芹有一种特殊的味道，略像药味，所以我们那边又叫它药芹，香芹比普通芹菜粗,茎叶都是是碧绿色的,而普通的芹菜比较细，下半茎部是白色的，叶子和上半部分是绿色的。
香芹是伞形花序多分枝，伞梗上端有短硬毛，复伞形花序直径2-7厘米。
3、出处不同：
原产地中海沿岸，原名西芹。我国栽培芹菜，据说已有两千多年的历史。芹菜有旱芹和水芹两种，长吃的是旱芹，水芹只在南方才能吃到。芹菜的特点是株肥、脆嫩、渣少。
香芹产地主要产自内蒙古、河南、山东、江苏等省区。分布欧洲中部至亚洲东部、苏联（西伯利亚东部及远东地区）、朝鲜（北部）。
香芹和水芹的意义 扩展
香芹：茎中空、通透，寓意为“路路畅通”“路路通达”。“芹”和“勤”读音相同，寓意为新的一年里“诸事勤快”“勤俭富裕”所以很多人家在年夜饭菜肴里，会用香芹烹调菜品。
水芹：水芹的茎是管状中空的，为讨口彩，含有“路路通”的意思，祝福人们在新的一年路路顺达，事事顺心，来年会格外捋起袖子勤劳奋斗。
香芹和水芹的意义 扩展
两者都是有香味的蔬菜，相比较而言，香菜的香味更浓烈一些。
香菜的叶子比芹菜叶子圆且小，芹菜的一片叶子分几瓣，边缘呈锯齿状。
香菜根部更细一些，须较少；芹菜须多，根整体大于香菜。
芹菜茎一边有凹道，从头到尾，每10-20厘米有一个节，上面有很多细纹；香菜的茎从根部就开始分叉。
